Resource Type:
Gene
Organism:
Name:
LOC108221893
Identifier:
LOC108221893
Cross Reference:
| NCBI Gene |  |
|---|
Relationship:
| Relationships |
|---|
| The mRNA, XM_017395747.1, is a part of gene, LOC108221893. |
| The genetic_marker, MK003284 K0728, is located in gene, LOC108221893. |
Analysis:
| Name | Description |
|---|---|
An orange, doubled-haploid, Nantes-type carrot (DH1) was used for genome sequencing. We used BAC end sequences and a newly developed linkage map with 2,075 markers to correct 135 scaffolds with one or more chimeric regions. The resulting v2.0 assembly spans 421.5 Mb and contains 4,907 scaffolds (N50 of 12.7 Mb), accounting for ∼90% of the estimated genome size of 473 Mb. The scaftig N50 of 31.2 kb is similar to those of other high-quality genome assemblies such as potato and pepper. About 86% (362 Mb) of the assembled genome is included in only 60 superscaffolds anchored to the nine pseudomolecules. The longest superscaffold spans 30.2 Mb, 85% of chromosome 4. There are a few different naming schemes for this assembly. First there is the Phytozome genome ID 388: The authors' sequences and gene predictions were also submitted to Phytozome, and can be accessed at this address: https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Dcarota_v2_0 LNRQ01: These sequences were then assigned GenBank accession numbers starting at LNRQ01000001.1 which corresponds to DCARv2_Chr1, up to LNRQ01004826.1 which corresponds to an unincorporated contig, DCARv2_C10750146. These reside in bioproject PRJNA268187, which is a subproject of umbrella project PRJNA285926. Assembly GCA_001625215.1: The genome assembly was later defined an accession number GCA_001625215.1 for assembly ASM162521v1 which consists of only the 9 chromosome sequences and the plastid assembly, which have accession numbers from CM004278.1 to CM004286.1 for the chromosomes and CM004358.1 for the plastid. The mitochondrial genome was not included because it is classified as an incomplete sequence. RefSeq: The assembly was then later added to RefSeq, and there another new set of identifiers was defined from NC_030381.1 to NC_030389.1 for the chromosomes, and from NW_016089425.1 to NW_016094239.1 for unincorporated scaffolds and contigs. These reside in bioproject PRJNA326436. Note that NCBI substituted different assembled organellar genomes from different genotypes for the RefSeq records. The NCBI Sequence report lists the correspondences between the various naming methods Link to the LNRQ01000000.1 master record at NCBI Raw Reads: Link to SRA accessions used for the genome assembly This genome is available in the CarrotOmics Blast Search | |
The RefSeq genome records for Daucus carota subsp. sativus were annotated by the NCBI Eukaryotic Genome Annotation Pipeline, an automated pipeline that annotates genes, transcripts and proteins on draft and finished genome assemblies. This report presents statistics on the annotation products, the input data used in the pipeline and intermediate alignment results. View the full report at https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_euk/Daucus_carota_subsp._sativus/100/ Data from this analysis can be viewed in JBrowse here. |
Transcripts:
| Transcript Name | Identifier | Type | Location |
|---|---|---|---|
| XM_017395747.1 | XM_017395747.1 | mRNA | DCARv2_Chr5:17000040..17021829 |
Sequence:
AACAATAATGTCACCGACATTTTTAATACCAGAAAAGATCCAGAACCTCT
CATTAGTCATTACACACCCATGGCTTTAGACAGGCAGCAGTCTATTACAC
TAACATCCAAACTCACCTGCAATGTCAACACCACCGATAACAACAATCCT
TCTTTCCATTCCCGCCGGAAAGTCCGTCGCCGCGGCAGTTTCGCCGCCGA
GCTACTCCATGGCCGGAAAAACTTACTTGGCTACCTGCTTTTCTTTTTGC
TCCTCTATCTAACTGGGCTGATCACATTTGTGGATCCCATCTCCGCTATC
TTCTATAAGCCCTCATCACCTGGTTCAGTCTACAAAAGTCATGAGATCTT
TGACAAACTTTGGCCCCAGATTCAGTCTGATAATTCTTCCGCTATTCAGG
TTGCATTACTCATCATTTACTATATATTTTCATACCTTTTATTAAAATTT
TATTCTGCAGAAGAATTTTTATTTTTAACTGTATTTTTGTATCCTCTTAG
TTAGCTCTGTAAATCAATTTAAATAAACTAGGTGATTGATTTTAATTGTT
GGATGTTAAGAAGGAATATAGATAAAATTAACTAGTGTATTACATTTACA
TTAGGAAGTTAAAATTATTCCTTAAACTTTAAATCTAAAGGTGTTTAACT
TAGGAACCATGAATCAGGCCAATTTTTTTGCAGCTTGTCATTTAATGAAT
ACAATGTTATTTTATTGACTACTTGACTATATGCTCACCCATAAGTTGCA
ACTTTTTGTCTACGTTGCCGATGTCACTGAGGCTAGTTTGTCAGTTATTG
AACTTTAGTAGCCAAGCAAGTTAGTTTTTGGGTTTTATATCAAACTGCCC
ACCCGTTACGTCAAAATATCTCACTTATCTTCCATCTCATCGGAGACTCA
TTTAAACCACTATAAACCAAACATATATCATTTTGCCCCTATCATTATTT
ATACCTCTTTACTTAATTATTTATCAAAAATCAATCGTTTCACTTTTTAC
TACAAAACTACTTCGAGTACTTGCATAATTGTTTCTAGTATTTATCAAAA
TAATTTGGGAATTTCTAAAGCAACATAGCTATTTAGTTAAAAAATTATAC
AACTATAAATATATATTTAAGTGATCACCCTAGCTATGTTGCTTTATAAA
TTTTCAAATTATTTTGATACATACTAGAGACAATTATGAAAGTACTCAAA
GTGGTTTTATAGTAAAATTTGAAACGGATGATTTTTGATAAGGGTTAATT
ATCTAGTTAGTCACTGAAGTGGGCTTAGTGTATCAAGTTAGTCACAGAAC
TGAAAACGGTATCAAGATGGTCAGTCACCATAAATATCAAACAAGTACCT
CGAAATATGAGTTCAAGCGGTAAAAATATTATTTATAGAGATTTACACAT
TATTCTTAAATGTTACCCCAACCAACTAAAAGGATATGACTTCTAGTATT
TATGATAATATATTTAGATTTTATCAGGTTTATTTATTATTTATTTTTAA
TTAAAACAAAGAAAATAACTATATAATAAGAACAAATAATAAATAAACTT
GATAAAATCTAAATATATTATTATAAATACTAGAAGTCATAACCTTTTAG
TTGGTTGTGGTAACATTTAAAAATAATGCGTAAACTTCTATAAATCATAT
TTTTAATGCTTGAACTCATATTTCAAAGTACTTGTTTGATATTTATGATG
ACTTCAGTGACCATCTTGATACCGTTTTCAATTCAGTGACCAACTTGATA
CATTAAGCCCACTTTAGTGACCAAATTGATAATTAACCCTTTTTGGTAAT
GATCAAGTAAAGAGGTATAAATAGTGATGTGGGCAAAATGATATATATTT
TGTTTATAGTGATTTAAATGAGTCCCCGATGAGATGGATGGGTCAAATGA
GATATTTTGACGTAACGGGTGGCCAGTTTGATAAAAACCCGTTAGTTTTT
GATAGATGTAATTCCATTTTTGTAAATTTCTTTTCAGTGAGTTTTCTTGC
GTTTCTTTTCAGGCATGGTGGGGAACACCACAAAGATTCAGAATGTTGTT
ATAGTTTGTTTTTGTAATTAAAATGGATAGTGTATGATCTTTAGGTTGTA
TAACCTGATAGTAAATGTTCCTTAAGAGAATCAGGGGTTTTTTGTTTTAT
TGGCAACAACTAAAATAATCTAATGTTGTGAAGTGCACCTTTCAACCTGG
AATGTTATCTTACCAGCTTTTCTAAAAACTGTGTTAGGAGGAAGGTTTAA
TTGGCCTTGGTATTCATAATAAATTATGAAAGTATTGAGGTTAAAAATCG
AACTCAAGACCTCTCCTCACTCTTGGATCATATCTTACTTTTAACATGTA
AGACACTAGTAAATATGTAATGTGCATATATCTAATTATAAGAGATTCTG
TAGCGTTATTACTATCTTGTAAATGCTGCTATTTTTTATCTTGCAGTTGT
CTACTGTATGGAAGTATAAAAGAAAACTAAAGGAGCATAAGCATTGTCTG
AATACTTATACCGCTCGTCGCCGTGGGCGGCGTCGCCATCTTGGTACATA
TATCTAAATGATATTTTTTTTCTTTGTTTATTTCCAATTCTGTTCATGAT
AGAATCATTGTCATGTTGGTTTCCAGAGCAAGTCCAAAAATTATTATGAA
AGGAACCCTAGTGATTTAGGATAATACTTTTGCAGATTAACTCCAACAAC
AATCCTTATACTTGTTCCATATTATTATTAGAGCTTATTGCAATTCACAC
CCCTAGACTTCGGCCCAAAAGCACTTTAGTATGCAGACTTTAGATAATTG
CACTTCGTCACCCACAGGTATTTTGTGCGCAGCAATTTGCAACCCTTCCG
TCAATCTCCGTTAAATATTTTATGTTTACCGTTATTTTAGGCGGGGTAAA
ATAGGAAATCCGACTGCAGGTGCCCAGAAAATGGCGATAAGGTGTAGATC
AGAAGAGGGAAACACTAGGTGCTCATTTATGGGGTTGGTTGTGTAAGATT
CCCAGCCGTTTGGCCGGAAATCGCGAGCAAAAGCGGCGCCGCCGTCGAGT
TCTTCGACTTCGGCGGGGCTCTACGCGCTGCCAACGTGAAAATTGAGGGC
ATGGTTCGATTGGAAATCACCTAAGCAATTTAATGGTACCATCCAATCTA
TCCCAGACTCAATAAATATGAAAATCCCAAAATTCAATCAAGAACATTCA
AAGTTCTCGAAGAATCCTAATTCGAAAATCAAACAGCAATTTCACCATGT
TATTGAAGTCCAAATCTGACGTATAATATATGAAAATGATCAGGAAAGAA
TTATCTACAACATGCACCTCATCTTTTCTCCAGTTGATAAAACAAAAACC
AAGTAAATTAGGTCTAATAAACATGAGATTAGGGCTTATATAAAGTAAAT
GGAGGAAGAAGAATATTAGAAGTGGATTTTCCCATTTTACCCTGCCTAAA
GTAACGGTAAACATAAATATTTAACGAAGACTGACGGAAGGTTGCAAATT
GCCGCGCACAAAATACCTGTGGGTGGCGAAGTGCAATTATCTAAAGTCTG
AATACTAAAGTGTTTTTAAGCCGAAATCTAGGGGTGCGGATTGCAATAAG
CTCTTATTATTATAATAATAAAAATTTGAATTACAACAATGTTTTGAAAA
GAGAAAAGAAGTGTAAAAATGGTGAAAAATGATTATTATGTTAATATTAT
ATAAAATAAGGAATGGCTAGGGGTTCTTGGAGTTTTAGGGAATTGGAACA
CCATTATATGGTACATTCCCTGAATTATAACTTAAGGACTCATGTAAAGA
AGTTGTTAGACTTGCTCTGAGAGTAAATTTCAGGCATATATTGTCTCATA
ATATGATCATCTAATTACCTGTAAAGGTACGTCAAACATTTTATTATGTG
ACAAAACTTTAACTTATGCAACCGTATGTAATTTGGTGAATCTTCCAGGT
AGGCTTGGACCTGATTATTACTTGATTGTTGATGCCAATGGAGGCCTCAA
TCAACAACGCTCGTCGGTATGTTGCTTAACATTACTCTTTGAATCATGTT
GTAAAACACACAGTCTAAATGACTTCGTATCTAAAATCCACACTACTCTA
TTGATATGGTCAGCATCTTCTCAACTTCTTCCTCCTCAACCCCTTGCTTA
AATGGGCTCACACATCTCTATATCTGCTTGAAGGCCCTAAATGCACCCCA
TAAATTTGTACCAGTAGGTTATACACTGAAGCTGTAGCTTGAGTTAATAG
CAATGTACTAGTTACTAAAACATCATTGAAGTATTTACCATAATTTGATT
ATACAGATGTTTAACGCTGTGCATCCCCAAGGGGGTGCCTTCAATTATTC
TTACACTTATATTAGCAATTTAGATCTCCAAAGGAATAATATAGCTAGTT
CCAAAAAAGAGAACCGGACATGCCACTCTCGGTTATCGCAACCTGCAATT
TTTTTTCTACAGATACTATATGGAATACATTCTCTCTTTTACTATAAAGT
TGTTTTTTGGGTTGTGAAAGGAATTAAAAATTATATAATAAACTGAATAT
TCTTTTTGGCGGGAGGAAAAAGAATTTCTTAAGGAGAAAACACTATGCGG
TAGAATGTTGAGTAGTGTTTCTAATGCAAGTTAAAGTAATAAAAGAAACT
AAGAGGAAAATATACTAGGTTATGCGGAACAAGGAATAAATATATTTATG
TAGGCTTACTTTACTAGAAATCAAATTAGCCTAGAAACTAGTTACAAAAA
CTAGTTACTGACCAATTTCTTTTATGACTGTTTTTAACTACAAAAATCAC
TTGTTGTGCATCACAATCACTATTTTTCATATAAGAAATTTCACAAATAT
AGATATATAAATACACATATATAGAACATATATCATCTTCATCTTCAATC
ATAGTACATTGATGAACCTCCGGGCATCATTATTAACCCCTTCCATTAGT
ACTGTAGTCACCTAAAATCACGATTGGCCTATTGCCGCTTGCCACCATAA
TTTGCCACTACTTGTGACAATTTTCCACTATCAAACACCACTTCTTGTCC
CTTTCTATCATCATGGACCTCATACAAATTTAATCATCAATAATCGACCA
CCAATAGCAAACTTAAGTAAATTTTCTCAATTATCAAATATAAAAATCGA
TTATATTACTGCATAAAATAGCTATTATTAGTGTATAAACCAATGATTTA
TGTAGTTATAAATAATGATTGTGGGAATGGTTTCTAGTTTATAGAATAAC
ATTGGTTTCCATTATATCACTTTCCTATTTGATCACTTGCCTATATATAA
ATATAGCCCCTTTTAGAAATAAACATAAACGTCACAATAAACATAACAAA
TTTAATAACAACAAATCTAGTAAAAAGGATAATATTGAAGAATATTATAA
AAAACCACATAAGTTTAAAAAGAAAACATTTAGCACAAATAGGAAATTTA
CTAAGAGTTTTGGTAAGAGAAGTTATTTGTCACATATATGGTAAATCAGG
TAATTATAAAAAATGAATGTAAAGTTAAAGAAAAACTTAACGAGTTACAC
ACACACACATATAGGAGTAAGATCCTAAGAGAACTTTTTATCGAGAGAAC
CGAGAGAACTAGCCTATCTACCGTAGATCACCCATTCTAATCCAATGGCT
ACTATAATTAGGAGATTTAGTAAATATTTATTAGCAATTCAATAAAGGGC
ATAATCGGACACAGATGATTAAAAATCTTTTGGGGAAATATTCATTTATG
ATCATATATACACATGATTTGGTTAACATAAATAATAAGATATGCAATCA
ATTGTTTTCCTTTTTTATATTCTCCATATCTCAATCAATCAACTAGAGCA
TTTAATGTATATTAAACTTTGAATTTCAAATTTCAAATTTTCAAAAGATT
CACCATGATGAAAATATTTAATTATCAGATATATCATTTTACGATATTTG
AGCGAACATTTTAAAGAATCTCAATTTCATATTGATTATATTCATATCAA
AATATATCCTTAGCAAACTGATAACCCGATTATATTTTATAATATATACT
AGAATATATTATTAAATGTATTTCTATAATGAAAAGAAAAATATAAATAA
TAAAATATAAAATTTTTACAAGAATCTTTTTTTTGAGAAATATGGCTTAT
AGCCTTGCAAATGAGTATCTGTTCTACGGAACTCTTACAAGAATCTTTAA
ATGTACATATTTTAGAATATCAGCATATTATAATATGTAGTAATTCTACT
AAATATTGAGATGTATCTTATTATACATTATTCTACTGTATTGTACCGAA
CATTTTTTAGAATCTTAATTTCTATTATTATAAAAGAATTATTAAGTAAT
CAGTATATTTCAATGACAAATGCTTAATAGAATCTTTTACATACATTATT
ATTATATTATTTCAAGAGTGTTTTTAAGAGAAATCTAATACACAAATATT
GATTTAGGAAATATTATTTGTGAGAAGATTCTCTTAAGTGTTTTAAATAA
ATGAAAATCTTAATTTATTATATTTCATTTTAGTAATGAATAATTTGTTA
GTAATTGGATTCCACAACTGCTGATTTAGGATAGAATCTTTAAATGTACA
TATATTAGAACCTCAGCATATTATAATATGGAGTTATGCAACTAAATATT
AAGATATATTAGAATCAAAATGAAGATTGTTTAATATATTCACTTATATG
TTTTTCTTATTAGGAATTCTATAAAGTGCTCATTAAATATAATTAAGTTA
GTATCCTATTTCAATAATAGAATTATGAGATTCTTTAAAAAATTACTTAA
ATATAGTTCATTGTATTAATACTTTTTATATTACTTATAACAAATATTTT
ATGTCAATTTTATAAAAAATATTTAAAAATTCTACTATATATCATTTTAC
GATATTTGAGCGAACATTTTAAAGAATCTCAATTTCATATTGATAGAATT
CATATCAAAATATATCCTTAGCAAACTGATAACCCGATTATATTTTATAA
TATATACTAGAATATATTATTAAATGTATTTCTATAATGAAAAGAAAAAT
ATAAATAATAAAATATAAAATTTTTACAAGAATCTTTTTTTGAGAAATAT
GGCTTATAGCCTTGCAAATGAGTATCTGTTCTACGGAACTCTTACAAGAA
TCTTTAAATGTACATATCTTAGAATCTCAGCATATTATAATATGTAGTAA
TCCTACTAAATATTGAGATGTATCTTATTATACATTATTCTTCTGTATTG
TACCGAACATTTTTTAGAATCTCAATTTCTATTATTATAAAAGAATTATT
AAGTAATCAGTATATTTCAATGACAAATGCTTAATAGAATCTTTTACATA
CATTATTATTATATTATTTCAAGAGTGTTTTTAAGAGAAATCTAATACAC
AAATATTGATTTAGGAAATATTATTTGTGAGAAGATTCTCTTGAGTGTTT
TAAATAAATGAAAATCTTAATTTATTATATTTCATTTTAGTAATGAATAA
TTTGTTAGTAATTGGATTCCACAACTGCTGATTTAGGATAGAATCTTTAA
ATGTACATATATTAGAATCTCACCATATTATAATATGGAGTTATGCAACT
AAATATTAAGATATATTAGAATCAAAATGAAGATTGTTTAATATATTCAC
TTATATGTTTTTCTTATTAGGAATTCTATAAAGTGCTCATTACATATAAT
TAAGTTAGTATCCTATTTCAATAATAGAATTATGAGATTCTTTAAAAAAA
TTACTTAAATATAGTTCATTGTATTAATACTTTTTATATTACTTATAACA
AATATTTTATGTCAATTTTATAAAAAATATTTAAAAATTCTACTATATAT
CATTTTACGATATTTGAGCGAACATTTTAAAGAATCTCAATTTCATATTG
ATAGAATTCATATCAAAATATATCCTTAGCAAACTGATAACCCGATTATA
TTTTATAATATATACTAGAATATATTATTAAATGTATTTCTATAATGAAA
AGAAAAATATAAATAATAAAATATAAAATTTTTACAAGAATCTTTTTTTG
AGAAATATGGCTTATAGCCTTGCAAATGAGTATCTGTTCTACGGAACTCT
TACAAGAATCTTTAAATGTACATATTTTAGAATCTCAGCATATTATAATA
TGTAGTAATTCTACTAAATATTGAGATGTATCTTATTATACATTATTCTA
CTGTATTGTACCGAACATTTTTTAGAATCTCAATTTCTATTATTATAAAA
GAATTATTAAGTAATCAGTATATTTCAATGACAAATGCTTAATAGAATCT
TTTACATACATTATTATTATATTATTTCAAGAGTGTTTTTAAAAGAAATC
TAATACACAAATATTGATTTAGGAAATATTATTTGTGAGAAGATTCTCTT
AAGTGTTTTAAATAAATGAAAATCTTAATTTATTATATTTCATTTTAGTA
ATGAATAATTTGTTAGTAATTGGATTCCACAACTGCTGATTTAGGATAGA
ATCTTTAAATGTACATATATTAGAATCTCAGCATATTATAATATGGAGTT
ATGCAACTAAATATTTAAGATATATTGGAATCAAAATGAAGATTGTTTAA
TATATTCACTAATATGTTTTTCTTATTAGGAATTCTATAAAGTGCTCATT
AAATATAATTAAGTTAGTATCCTATTTCAATAATAGAATTATGAGATTCT
TTAAAAAAATCACTTAAATATAGTTCATTGTATTAATACTTTTTATATTA
ATTATAACAGATATTCTATGTCAATTTTATAAAAAATATTTAAAAATTCT
ACTATATATCATTTTACGATATTTGAGCGAACATTTTAAAGAATCTCAAT
TTCATATTGATAGAATTCATATCAAAATATATCCTTAGCAAACTGATAAC
CCGATTATATTTTATAATATATACTAGAATATATTATTAAATGTATTTCT
ATAATTAAAAGAAAAATATAAATAATAAAATATAAAATTTTTACAAGAAT
CTTTTTTTGAGAAATATGGCTTATAGCCTTGCAAATGAGTATCTGTTCTA
CGGAACTCTTACAAGAATCTTTAAATGTACATATTTTAGAATCTCAGCAT
ATTATAATATGTAGTAATTCTACTAAATATTGAGATGTATCTTATTATAC
ATTATTCTACTGTATTGTAACATTTTTTAGAATCTCAATTTCTATTATTA
TAAAAGAATTATTAAGTAATCAGTATATTACAATGACAAATGCTTAATAG
AATCTTTTACATACATTATTATTATATTATTTCAAGAGTGTGTTTAAGAG
AAATCTAATACACAAATATTGATTTAGGAAATATTATTTGTGAGAAGATT
CTCTTAGGTGTTTTAAATAAATGAAAATCTTAATTTATTATATTTCATTT
TAGTAATGAATAATTTGTTAGTAATTGGATTCCACAACTGCTGATTTAGG
ATAGAATCTTTAAATGTACATATATTAGAATCTCAGCATATTATAATATG
GAGTTATGCAACTAAATATTAAAGATATATTGGAATCAAAATGAAGATTG
TTTAATATATTCACTAATATGTTTTTCTTATGAGGAATTCTATAAAGTGC
TCATTATATAATTAAGTTGGTATCCTATTTCAATAATAGAATTATGAGAT
TCTTTAAAAAAATCACTTAAATATAGTTCATTGTATTAATACTTTTTATA
TTAATTATAACAGATATTCTATGTCAATTTTATAAAAAATATTTAAAAAT
TCTACTATATATCATTTTACGATATTTGAGCGAACATTTTAAAGAATCTC
ATTTTTATATTGATAGAATTCATATCAAAATATATCCTTAGCAAACTGAT
AACCCGATTATATTTTATTATATATACTAGAATCTATTATTAAATGTATT
TCTATAATTAAAAAAATATAAATAAAAAATATAAAATTTTTACAAGAATT
TTTTTTGACAAATATGGCTTATAGCCTTGCAAATGAGTATCTGTTCTACG
GAACTCTTACAAGAATCTTTAAATGTACATATATTAGAATCTCATCATAT
TATAATATGTAGTAATTCTACTAAACATTTTGATGTATCTTATGATACAT
TATTCTATTTAGAATCTCAATTTCTATTATTATAAAAGAATTATTAAGTA
ATCAGTATATTTCAATGACAAATGCTTAATAGAATCTTTTACATACATTA
TTATTATATTATTTCAAGAGTGTTTTTAAAAGAAATCTAATACACAAATA
TTGGTTTAGGAAATATTATTTGTCAGAAGATTCTCTTAAGTGTTTTAAAT
AAATAAAAATCTTAATTTATTATATTTCATTTTAGTAATAAATAATTTGT
TAGTAATTGGATTCCACAACTGCTGATTTATTTTTATATGCTACAAAGAA
GAGATATGGGACAGTGCCGCTTCACCAAGAACGTTATTAGACACGTGGAA
AGTTGTGTTCTTTCACATTGAATATTGTATTACCAGATAGATATAGAAAT
ATTCCACAAGATACTCTCAAGCATCTTGGATGCCTCTTGAGTTAAAACTC
TGTCGTCGCTAAAAATATAACAAGAATTCTTTTTCTTTACTGATCATAAT
AATCAACATCAAGAAGCACCGTTCTAAAAGTAACAATATAAATTTAATTT
AACTACTAGATAAAAAGTCTTACAATCAAAGACGCAAATTCTAAAAACCA
ACTAAAAGTGCAACATATTCCTTCCTCTCTTAGATTCCATAACTCTGTGT
AAGACTTGTTCAAGAATACTCTGAAGAACTCCTTAAAAAAAGTTAACAAA
TGCTCTGCAGAATAAAACAAAAAATCGGATTTAGTTTTATAGGTGTTGTT
AGCTAAAAGATTAGTTACAAGAATTGTTTAAAACATCCTTGAACAATGAT
AGGAAAGACCTCAAACCTTGTAATTTTCTCCCTGTTCTCCATTGTCAACT
TCTGTATCTCCCTTATTTTGCTTCTGTGATTATGAAAAAGAAGAGTATCT
CTTGTATGTGTTTGTATATATATTGATAATCAGAAATTTGATTAATCTTT
CCATTTTAAAGTTTATTCTGATTGATTTGTATGAAATCAGATGTAATCAA
AAACTTCCATGTTTAGTAGATTCTTTGATGATCACATTTAAATTACTAAG
CAACATGCCCAATGTACAGAAGATTATTACATCAATGCCATTAAATATAT
CAGTTTTAATTTTGAATACAATTACAATATATCTACGGTTACTATTAGAT
CTCTCAGTTCTCTTGATAATAAAGTTCTCCCTCGAACCTTATAAAGTTCT
CCCTCGAACCTTACTCATATATATATNTAATTTATATATAGCATATCTCG
CGAATATGAATACACACACACACACACACATATGCAACGTATATGACCAT
CATCTTCACCCAAATCGTAATAATGAACCTCTTACCACTATTACCAGACG
TTTCTATGACTTTCCACCATTGTCTATCATCACCAATAGTCACATACACT
TTCCATCATAACTTACAAAACTAACGACTACTTCCCATCATCGTACAACT
TCTCTTGCGGCTTCCTACCGCTAAGAACCTTTTTACGGATGAAATTGATC
ATCTATAATCGATTATCAATAGTTTAGATAAGTAGATCTTCTCAATTTTG
ATAACAAAAATCGCTGTTTACATACTGTATAAAAACAGTGATTAGCGCAG
TATAAATTAGTGATACACGTAGTTATAAATAGTGGTAGGAAAACTGATTT
CTAGTTTTTATTTTAAGAGTGGTTTCTATTTGATCATGAGCCTATATATA
TATATATTTGATGAAGATACTTAGTCAATCCTCTAATTAATGAGGATTGA
AAATGAATCCAGTAATGATGATGAACATTATTCAGATGTACTTTTTTAAC
TAACAAGTACTACTAATATAGAAAGGTATAATTGTAAACCAAACATTACA
ATAGGATGTAATGATAATTGTCACAATTGTTGTATTAAGACACTAAATGT
ATTATCTAAAAGTCAGGAAGAAGAATAAATTGATTTATTAATAAAATAAG
ATCCACAATTAATAACACAATATACAACTATATTAAAAACTGTAATGGCA
TCAGACAATGTAACCAAGACAAATGGAAAACAAGAAAAATCTATATTTAG
TCTTGATAAAGCAATTGAAAGATTTAAAATCTCAGTTAAAGAAATAACTT
TATAGATTTAAACTAAGAAGTCAATATTAGAAATAAATAAATTACTTGCT
TAAAAGAAAAAATTCTGAAATTAAACAAATTAAAGCTAAGTCTGAATTAT
GAATCCATGATTCTTCTGATGAAGAAAATTTTGAAATTAATGAAAATCTG
AATTACTTAAACAACAAGGTCTTTCATTAAGCATACTAAAAGATATTACT
ATCCAAAAATGATATATTAATATTAAATTAATAATTAATAAAACTTCTGT
CATTGAAACTTTTGCTCTTGTTGATTCAGGAGCTGATTTAAATTATATTC
AAGATGGACTAAATCCAATAACGTATTATGAAAAAACTAATGAAAGGTTA
AGCTCAGCTAATAGTAGTCAAATGAAAATTGAATAGAAATTATCTAAAGT
TCATATTTGTGAAGATAATATTTCCCTTAAAACTTCTTTTGTCTTAGTAA
CAAATATGATTGATAAGATTATATCATGTCTACCTTTCATATACTTTATC
CTTTCACTACTTCAACTAATAAATTGATTAGTAAAGACTTAGGCCAAACA
ATAACATTTAATTATATCTTAGAGCCAAAAGAAAAAGAAATGAGAACTAT
TCAAGAAGAATCAATTACTAAAACTCTTACATTATTAAACAATAAAAAGA
GTCAATTCAAAATATTTATAAAAAAAATGAAATTATATATAAAGGAATTG
AGGAACAATTAAAAATAGTAATATCCAAAATAAGATCAAACAATTTAATA
AAACTCTATTAAATGAAATTTTGTTCATTAATCCCTCATGCCTTTTGGCA
TAGGAAGAAACATTTAGTCAACCTACCTTATGCTAAAGAATTTAAAGAGC
ATTTAATTCTTTCAAAATCTAGACCTATCTAGATGAACTATGAACAATTA
GAATATTGTAAGAAATAGATAAACGAATAACTAAATAAAAGATTAATTAG
AAATAGCAAATCACCATGGTCATGTGCAGCTTTTATGTTAATAAAAATGT
TGGAAAAAAGGAATATCGTACTTGTTAACTAAAAACCATTAACAAGGTAC
TTGAATGGATTAGATATTCTTTACAAAATAAAAAAGATTTAATAAAGAGG
TTGAACCAAGCAGTTATATTTAGTAAGTTTGATTTAAAAAGTGGGGTTTT
GACCTTGAAAGCAGGTATACTCCATATAGGAGAAGAACAGCGAATAGGAC
ACGTGGGGGTGTGCGGGGGTGCGGCGGAGTGCGTACGGGATACGCCACGT
GGCGTATCGGTGGAGGCAGCGAGGGGGATACGCGGGGGTGCGGGAATGGG
GGTGCGGGAGTGGCACGAATTGTAATTTAGAACAACTTTTTTTCAAAGAA
AAAGCTTCAAATTAATCAATCAAAACCTGTGTTACTCCTTACTTGTCTAT
ATGTGATCGGATCCTTCGTTGTCATCGCCGGAAAATCTTCTGCAGGTTGT
CGGAAAGAGCTGCAGACTCACGGCGGGATGAATGAAGTTTGGCGAGGGAC
CACGGGGTAGAAGAGGGCAGAAGAAGAGGGGAGATGAATGGGGGAGATAA
GAAAATAAATTCTACTGATCTGTGTTTCATGTATACGTATGTATACACTT
TGGTACACGTGAAATGAACCTGGACTGAGGGATGTCCACATTCTTTTTTT
AATTTTTTATTTACCTTTATCACTTAATGGGCTTCCAGTTGTTATAATTT
CATGTAATACCAATTTGTACTACCAACACTAACATTAATTTAGGAACTAA
TTAAACTTCTGAATTCACAATTTTAAATATAAAAATAAATGGTTTAATTG
TTATGAAAATTTTTAAATTATATTTATTTATATAATAATATATATGTATA
TATAATATTTTTAATATTTTAATATTTGCCGTATCCCCTCGCACCCGTAT
CCCCATATTTTGGAATTCGACGAATTCCTATATCCACATACCGCACTCTC
GCACCCGCACTTATGCTTCCTAGGTTTTGAAAAATCTAAATTAGTAATGA
AGATAGGTATAAAACTGCCTTTACTACTCCCTTTGGTCACTATGAATGGA
ATGTAGTTCCATTTGGACTCAAAAATTCCCCTAGTGAATTCCAAAATTCA
CTAATAAATATATTCAACATTTTTAGTCCTTTCTCAGTAGTTTATATAGA
CGTTGTTCTTGTTTATTCCAATTCAATTAAAGAACATTGGAAACATTTTA
AATCTTCTTTTAATACAATTAAGACCAATGGCCTAGTAAGTGTGTCTTAT
TCCAAACGAAAGTAAGGGGTCATTTGTTAACCCCTGGACGAGACTAGATT
AGTTGGATGAGGCATCGTTCAGGATTCAAGTCATTTGTTTAAGTTTGTAA
GTTGTTGGACGACGTCTACAAATCTTCTGGACGTCCCGGCCTTGATACTG
TAGCTAGATGGTTCAAAAGGACGCCCGCAGCATGTGCCCACTTTCCAATT
TTGATTTTTGTTGGCTCTTATGAATTTTAAATTTTACAATTTATAATATG
TAATATTAATATAGTTTATAATCTTTATTTGCATACTTACACTATATTTT
GATTATATTATTTGTTTATTTGAAATTTTTTTTTCATCATATTTTTTACT
CATCCAGAAATTTGATTCAGATTTAACAAATGACAAAATAATTTATTCGT
CCAGAAATTCTACCCCTTCAGATTTTTTACTCATCCAGAAATTTGATTCA
GATTTAACAAATGACCCCTAAGATTACTTGATAAAACCCAACTCCAAAGA
TTTTTAGGATCACTCAACTTATCACTCAACTTAGGAGACTTTTACAAAGA
TCTTAGGAAGCAATGTAAGCCATTATTTGAACGGCTATCAGGTAATCCCC
CACCTTGGACTTCAATCGATACTTCTATTGTCTAAGATTTTTAAAAAATT
ATGTCAAGACACTTACCTATCTTGGTATTTTTAATCCCTCTGCATTCAAA
ATAGTGGAAACTGATGCATGCGAAGTTGGATTTGGAGGAATCCTCAAACA
AAAGTCAAGTCTTTCTTCACATGAAGAAATTGTTTTTTTTACTCAGGTGC
TTAGCACCATTCCCAACAAAATTATTCATCCATAAAAAAAAATTAAGTTT
AGTTTTATGCATCAATAAATTCCAATGAACTTTTAAATCAAATTTTTTAA
GTCAGAATTGATCGTCAGTCAGCAAAATTTATTTTAGAAAATGTTCAAAA
TATTGCATCAAAACAGATTTTTGCTAGATGGCAAGCATTAATAATCATAT
TTGATTTTGATACACAATACATTAAAGGGAGTGAAAAATCTATTCCAGAT
TTTCTAAATAGAGAATTTCTACAAATAGGAGTGAAAGATGAGTGTAAGAG
ATAATCCAGACAGTATTCGAGGAGGTAGTAGCTCTCACGGGAGAGACAGT
TGTGATAGTAAGCTTAAAGGAGCAATAGGCCTTCATCTAGTTATTCCAAT
CCAACCAGTGAATCTAGTTAATAGACACCAAGTTTTAGGCCAAATCCCTA
AATCGTATAACATGGTCCTAGCCAGTAAACCACTAGTTATTGATCCTTTT
GCAACTACTAGTAAACCTATTGTCCCATTTGTCCTTTTTAACATTTTTGG
AAAACCAGTTTTTGAATATACTCAAAATCATGAAGAAAATACTTACCAAA
AAAAAAAAAAAAATCATGAAGAAAATAATATCAGAGCATCTCCAACGGGT
TGGCCATAATGGTTGGCTAAATTATACCTGTTCATTATGTAAAATTTGCT
GAACCTGTAAGACATTTTGCTTCGATGGTATTGTCTATATTGGTTGGATA
TAATTTAAAAATAGTATGTTTTAATATTTTTGATTGTTATAAATAGAATA
TATCACTTTAATATGGTAATAAGTGATGTGTAATCTTCCTACAGATTTCT
TACAAGCCTGTAGTGGATCGACAAATATAGTCATCCATAGGAGGTTGACT
ATAATTATAGACAAGGGGTTGGTATGGTTGGAGTGTTTTTTTTTGAAGAT
ATAGGCTATATATTTTACTTTTGGTATGCCGACTAATTTTTTAGCTAAGG
GCGCTCCATGGTTGGAGATGCTCTTAAGAGCATCTCGAATGGCGTTGGCT
ATAATCATTGGCTAAATTGGACCTGTAAAACATTATGTAAAATTTGCTGA
ACCTGTAAGATATTGTGCTTCAATAGTATTGACTATACTGGTTGGTTATA
ATTTAAAAATAGTATGTTATTAATATTTAGATTGTTATAAATAGAATATA
TCAGTTTAATATGGTAATAAATAATTTGTAATCAGTGGGAAGGAGGAAAA
TAAACTGCGGAAGATGACGTGGAATTCACTACAGATCTGTAGTGGTTCGA
CAAATATAGCCGTCCATAGGGGGGTGGCTATAATTATAGACAAGGGCTTG
CTATGGTTGGAGTGCTGTTTTTTGTGGACATTGGCTATAATTTTTAATTT
TGGTAAGCCAACTAGAGTTTTAGGTAAGGGCTTCTCATGGTTGGAGATGC
TCTAAATACCTTTTTCTGACATTGTGGGTAATCGTGAATGACCTAATAAG
TTCAGTATCTTCTTGGTCATGTACTTTCTGCGTGAGCATCGCCTACTGAA
CTTTTTGTTTTCTCAGATCTGCAATGCAGTGGCAGTTGCTGGACTATTAG
GTGCAACATTAATTATTCCCCGATTTGAGCTGCACAATGTTTGGAAGGAT
CCAAGGCAAGTAATTTAATATGACCTTGCTATGTACTTTTTCGTTGGGAG
AATTCTTCATTTCTTTCGGCTTCCTGAAAGTTTCGATAGAAAATAATGTT
TTGGCTTTTATGTAACTTCCAGAAGATATCCTTTTGTGGTGAAAAATGTG
TACTTGAATTTTGTAATGCCAGTAGGCTTATGTAAATTCTCCCCGATTTT
TGCTTACTTGAGTTTCCTTTTGAGTATACATAATTTCTCCTTTGTCTACC
TTCTTGTTATTGTTCATTACCTTAAAGTTGATAATATGAAAGATAAGATT
CAAGGCAGGAGAGAAGCAGTCAAAGAAGTCTAGTTATCACAATCATTTAA
TTTAAAGGTGAGGCTATGCAGTTATCAAATGCTTGGATGTGTTGGCATTA
GGTGAAAGGCAATGTAAGACACCAAAATTTTGCATGCTTAAATCTCTAGA
TTAAGGAGTAACAGTTTTCTGTGTTATATCAGCGTTATGTTCAATCTTTG
GTGTAGTATAATAAATTTGGAATTTAGAGTGTTAGCATGTATGGATATTT
TTCGTAACTGTATGTTTTTGTATGCACATGCTGAAGCTCAATACCGTGTG
TTTCCTTTAAATTTTATGATGATATCTATGTTATCTTTTCCCGACTTGTG
CTTTGCAGTTTATTTTCGGATATCTATGACGAGGATCATTTTATCAACAT
TCTTCAGGGTCATGTGAATGTGGTGAGGGAGCTCCCAAAGGATTTAATGG
AAAAGTATGATAACGTCAGCAATATGAAGTACCTAAAAGTTCCTGCTTGG
GCTTCTGCCAGTTTTTACCTAGAAGAAGTTCTACCAGTCTTACAAAAGCG
CAGGTAGGTAGTTAATATCTCCTAAATTTTGTTGCCCAAACTTGTGCCAG
GAAGAACACTTCAGTTATCAAGTCGAAAGTAAATTAGTGACTTATCAAGG
GAAAAAGATAATTAGTCAGTTTCTGCATGTAAAATGTGAGACCTCATATG
ACCTTTGATGGAAAGGTTTCAATTCTTATTCTATCTTTCCAAAGTGATGA
TATATTTATGGTGAGGGATGCCGTGTCATGGAGGGTAGCCGAGCCTCTAA
TTTTGAGAGAGATGATTGCACAATAACTAGCTATTGTAGGCTATGGTGTT
GGCGTCATATCAGACAAGAGAGGAACAAAAGTGACTAAATACAACACTTA
TATAATGAAGTCAAGGAGACTTGTGCAAATCTTATGGAGGTCCAAACTCT
GCATGTTTTGTTACTCATGATATACTTCAGTGTTTTAATAGTTTATACAA
CATTGCTTTCGACTTGCAATCAGAAAGCTGGCAACACATGTTGCATTGAT
GTCACCATCCATTGTGCAATCAGTCAATTTTATTAAAACTCATCCCTTCA
ATTTTTGATTTATACCGATTATATTCTATGCTATGACAGATTGTAACTCA
AATTTGCTTAAATACGCACTGTATTTACCGTCATTGTGTGTACTTCGTTA
CATGTTCATACAGGGTTATCCGCATTGCTCCATTTGCAAATAGATTGGCA
GTTAATCTACCTCCACAAATTCAATTTCTGAGGTGCCTGGCCAATTACGA
AGCCTTAAAATTCGTCGATCCCATCTTAATGCTGGCAAGAAAGTTGGTCA
AGCGTATGACTAAAAATATCTTAAGCTCCGGCGGTGAATTCATTTCAGTC
CACCTTCGGTTTGAGGAGGTAGAATATGTTATACTTATATGAATTCTGTC
ATTTTTATTTAATGTTCAAGTAATATTTGTCTGAAATACCATTGTCCATA
CATTTGTACTCTTAGGACATGGTGGCCTTCTCATGTTGTGTTTATGATGG
TGGAGTAGCTGAAAGAATCAGGATGGAGTTGGTACGTGAAGAAGGATGGG
GAGATAAGTTCAAACGAAACAATCGTGTAATTGAACCTGGTCTCAATCGA
ATTAATGGGAAGTGCCCCATGACCCCTTTGGAGGTTAGTTTATTTAATTT
TTTTCGTATTCTACCAGCTCATTGATTTCCTCTCCCATTTTTACTTTTTC
AAAAAATAGTAGTCACATCTTATATTTGAGCTCCAATCTCTGTTCCTTTG
TTGTCTTTCAAAGTTGTTCTTACACTGCCTTGTAAATTTTAAAATGGAAG
AGAAAGTTAATCAGGACATTCTTAGATCAGGTTTTTGAAAATGTATAGAT
GTATCTAATAGTCTCACAAATTTTCATTGAGTAGATAATAAAATTCTGTT
GTTTTATCTTTTCGTTGTCAGCATAGGTTGGAATGATGCTAAGGGGTATG
GGATTTACCAACAACACTCCAATTTATTTGGCCTCGGGGAAACTTTACCA
GGCTGAGAAATACTTAGCACTTCTGAGGAAGATGTTTCCTCTTCTAGAGA
CGAAGGAATCACTTACAAAACCAGATGAGCTTGCTTCATTTCAGGTGAAT
TATTAAATAAAAATAAACAATAATAAGTACTTGACTTCTAAAAGGTCAGT
AACTTTGGTGTTTTTGACCATAATAGTTTAACTTTTAGCCGTTGTTGCAT
CAATGTTATAAAATTATTATATATTGCTTGTAAATTTAATTTGAAAGAAA
TAGTATTCTCAGAACAGTGTGGATTGTTGCCATAAATCTATTGTCTTTAG
CAGTGAAAGTAAAAGTAAAAGAAAACGTAGCCATATTTGCTTGCCAGCCT
TCATTCTCAGAGTGTCCGACCATCCTTCTTTACTCGACTTGACTGCTATT
TGGAATGTCCTGAAAATCTAAGTGATTCACATCACTCCACACGGGGCATT
GGCTGTATGACTACTGTATTGTGGAAGGAAATGATGATAGGCATATAACA
TAAAACATTTCTTACACCTACTGTCTTCTTTGAAGTGTGTGGCAGTCAAA
CTAGGTGAATAATTATATATCCTTGGTCATTGTCGAATAAGTTTTTTTTT
ACTGTGGTTACCAAATAGCAACGGCAGCTTATAGTAGAGTGAGCAAGTTG
ACTTTGTCATTTGATACAGATTTCTCTCTTTGATTGATTAGGGCTTCTCT
TCGAGGTTGGCTGCTCTTGATTACATGGTCTGCTTATCTAGTGAAGCATT
TGTTACCACTCAAGGTGGAAACTTTCCACATTTTCTCATGGGTCATCGAA
GATTTCTGTATAATGGCCATGCTAAGACCATCAAGCCGGATAAAATGAAG
CTTGCACGTTTACTGTATAATACTAGTATCAGGTATTTAAGTCTACTGCT
GCTTCTTACTGAGAAACTTTTTGTCTCTGGATATGATATAGCATTGCCCA
GTAATTTCATTAATTGTGGAAAAAAAGTTGGGTTGGCCTTGTAAAACAAA
TAAAAAATCAAACATATAATGAAAACATGCACTTCTGACTTGTTTTTGTA
CAAATAGCAATGTCTATAGTGCTAGCAAATTCGGTATAGAGGGTTGTATA
TAAGGTATAGGGTGACACGGAGTAAACTATGCCTATGAAACACAATCTTG
TTAAAAGAGGCAAAAAAATAAGCTACCCTATCTAGGCAAAGGAGAAAATC
TTACTTGATCAAGATCATGTGTGCATGGTGACTATGTATTTTAAAGTTTT
TTTGTGAGATAATATGCTTTTAGATTATTTTTTTTCAAAAAAAATGCAGA
AACTTAATACGTTTTACAGTCTAGAGAGATGATACAATAAGATATAGGGT
TGAGTCAACCTATAGAAATTGATATATTCTTTTGGAATTAAATACATTTT
GATCTGTTTAGCAACTTTGGCTATGTTATGTCATTGTCATAATTTTAATA
ATACCTGAGGAGCTGAGGAAGTAGAGATTGTCTTCCCAGAATAAAGCAGA
AAATGATAAAAGTAATGCAAAGTAATATTCTAATGGATTATGTATGAGTG
TATGAAACGACTTGATGCAAATTTTTCATAGTTCTCGAATTGTAATCTGA
TAATACTTGCAAGCATTGCCTCTAATACATGATGGGAGAACTACCATGTT
TATTTCTGTTCCAAGAAACTTGGAGACTGCTGGTGTGACTATCTTGATGA
TTAAAGTTTTATAATTTGCTTACAGTTGGAGCTCCTTCAAGGATGAAATG
AAATTAATGCTTGCAGAAAGTGACCGCCGGAGTGTAATGGTACCTAGATC
TGTAAATAGCAATAGAAGGGATTCTCTGTACTCGAGCCCTTTTCCAGAGT
GTCGATGTGTATGGGAAGCATGGAATTCAACCCTCAAATTACCTCATGCT
GTTAATATGCAGGGTCATTAACTTGACCCTTTCACGGGAATGTTGCTCAT
TCTACATATACTTCTACCACTTGTGCTGTCAAGACGCATATAATATACTT
AACTGCAGCTATGTAGTTTGTTCTTTGCTAAATACTGTTGCAACTACATG
GAAGGTTGTACACACGACAAAGTCGTAAATATGAGGGAGAATTTTATCTG
CTCAGCATTATATAGCATTTGGAATGGAAAGTTCAATTTCTCGTCCAGTT
TCGATACTCGTACGTGAATTGCATGTTGAATCTCGAGGAAAACTACTTGT
GGCTCTCTTAGCATATATGCTATCTATGCATCACCGGTGGCGCATACATT
TAAAGCAATAAAAGGATTACATGTTCCGAACTTGTGAAGCTAGCAAGCTC
TTCAGCTGTCATTCCTACATTCATTATGTCTCTTCCTTGTATACTAGTTA
ATAGTTATGAACATCTGTTTAGGCAGGAAATATTTGGAAATTTATAAGGT
TCGTCTGCTACATTGTCGCCTCTAGGTTTTGTTGCTTAAGGACCTCTGTT
TTGTATTGTGGAAGTACCTTAGCAGCAAATGTTGAGAACTATCAAAGTAA
ATCTTTATGAAGCTTCAAGGCTTGTTCGCTTTGTGCTTA
Sequence Length:
21789
Sequence Checksum:
3bc159b89cf73f74c11b57d6df546d03
View location in JBrowse:
Gene:
LOC108221893
Gene Biotype:
protein_coding
Gbkey:
Gene